Để không "vướng" thủ tục: Doanh nghiệp cần rà soát ngay 7 nội dung về đăng ký thuế

Việc chuẩn hóa dữ liệu đăng ký thuế giúp doanh nghiệp hạn chế vướng mắc khi thực hiện các thủ tục thuế điện tử.

Chuẩn hóa thông tin đăng ký là yêu cầu đặt ra với doanh nghiệp

Thông tư số 90/2026/TT-BTC không làm phát sinh nghĩa vụ thuế mới nhưng chuẩn hóa toàn bộ quy trình đăng ký thuế. Doanh nghiệp nên rà soát ít nhất 7 nhóm nội dung dưới đây để bảo đảm dữ liệu đăng ký thuế luôn đồng bộ với cơ quan quản lý.

Một là: Xác định đúng đối tượng và phương thức đăng ký thuế. Theo Điều 4, ngoài doanh nghiệp thông thường, Thông tư số 90/2026/TT-BTC còn quy định đối với nhà cung cấp nước ngoài, nhà thầu nước ngoài, tổ chức khấu trừ nộp thay, chủ quản nền tảng thương mại điện tử, tổ chức kê khai thuế tối thiểu toàn cầu...

Hai là: Rà soát lại cấu trúc mã số thuế của doanh nghiệp và đơn vị phụ thuộc theo quy định tại Điều 5 về mã số thuế 10 số, 13 số và nguyên tắc sử dụng mã số thuế.

Ba là: Cập nhật đầy đủ thông tin đăng ký thuế khi thay đổi người đại diện, địa chỉ, đơn vị phụ thuộc hoặc các thông tin khác theo Điều 9, thay vì chỉ thực hiện tại cơ quan đăng ký kinh doanh.

Bốn là: Rà soát hồ sơ và biểu mẫu. Thông tư số 90/2026/TT-BTC thay thế đồng bộ nhiều mẫu như 01-ĐKT, 02-ĐKT và các bảng kê BK01 đến BK07 áp dụng cho từng trường hợp đăng ký.

Năm là: Chuẩn hóa dữ liệu giao dịch điện tử. Hồ sơ đăng ký thuế được thực hiện qua Cổng Dịch vụ công quốc gia, Ứng dụng định danh quốc gia hoặc Hệ thống thông tin quản lý thuế, vì vậy doanh nghiệp cần bảo đảm thông tin chữ ký số, email, tài khoản giao dịch điện tử luôn chính xác.

Sáu là: Rà soát hệ thống đơn vị phụ thuộc, địa điểm kinh doanh để bảo đảm thông tin khai báo thống nhất với dữ liệu quản lý thuế, nhất là đối với doanh nghiệp có nhiều chi nhánh.

Quy định về hồ sơ đăng ký đơn vị phụ thuộc, địa điểm kinh doanh được hướng dẫn khá chi tiết tại Chương II của Thông tư.

Bảy là: Kiểm tra doanh nghiệp có thuộc các trường hợp đặc thù hay không, như doanh nghiệp có giao dịch với nhà cung cấp nước ngoài, thực hiện khấu trừ nộp thay, tham gia thương mại điện tử hoặc thuộc phạm vi áp dụng thuế tối thiểu toàn cầu để thực hiện đúng hồ sơ đăng ký và kê khai.

Quản lý đăng ký thuế chuyển mạnh sang nền tảng dữ liệu số

Một điểm nổi bật của Thông tư số 90/2026/TT-BTC là đẩy mạnh phương thức thực hiện thủ tục bằng điện tử. Theo Điều 6, người nộp thuế thuộc diện đăng ký trực tiếp với cơ quan thuế thực hiện nộp hồ sơ điện tử thông qua Cổng Dịch vụ công quốc gia, Ứng dụng định danh quốc gia hoặc Hệ thống thông tin quản lý thuế.

Hồ sơ điện tử được tiếp nhận, phản hồi và xử lý trên môi trường số; trường hợp hồ sơ chưa đầy đủ, cơ quan Thuế sẽ thông báo lý do để người nộp thuế hoàn thiện.

Điều này đồng nghĩa doanh nghiệp cần chuẩn hóa đồng bộ các thông tin như chữ ký số, thư điện tử, thông tin người đại diện theo pháp luật và tài khoản giao dịch điện tử để bảo đảm việc thực hiện thủ tục không bị gián đoạn.

Một nội dung khác cũng đáng quan tâm là Thông tư số 90/2026/TT-BTC dành quy định riêng đối với nhà cung cấp nước ngoài, chủ quản nền tảng thương mại điện tử, tổ chức khấu trừ và nộp thay thuế, phù hợp với các quy định mới tại Nghị định số 252/2026/NĐ-CP.

Bên cạnh đó, Thông tư số 90/2026/TT-BTC cũng bổ sung quy định về tổ chức kê khai và nộp thuế thu nhập doanh nghiệp bổ sung theo quy định về thuế tối thiểu toàn cầu vào nhóm đối tượng đăng ký thuế.

Quy định này tạo cơ sở thống nhất về quản lý mã số thuế đối với các doanh nghiệp thuộc phạm vi áp dụng cơ chế chống xói mòn cơ sở thuế toàn cầu.

Với các quy định mới được ban hành và có hiệu lực từ 1/7/2026, việc doanh nghiệp chủ động rà soát thông tin đăng ký, cập nhật hồ sơ và chuẩn hóa dữ liệu không chỉ giúp tránh các vướng mắc về thủ tục, mà còn là điều kiện để thực hiện đầy đủ các nghĩa vụ thuế trong môi trường quản lý số hóa.