Kê khai phí, lệ phí hải quan với cơ quan Thuế như thế nào?

	Hải quan Nghệ An bắt giữ và xử lý 116 vụ vi phạm
	Hải quan Nghệ An thu ngân sách đạt 1.221 tỷ đồng
	Hải quan Nghệ An bắt đối tượng vận chuyển 4 kg nghi là ma túy đá

Theo Cục Hải quan Nghệ An, đối với các khoản thu phí hải quan các đơn vị trực thuộc có phát sinh thực hiện thu nộp vào tài khoản tiền gửi của Cục Hải quan Nghệ An. Sau đó, bộ phận Tài vụ quản trị thực hiện nộp vào NSNN và thực hiện kê khai, quyết toán đối với cơ quan Thuế theo quy định. Số tiền quyết toán phí hải quan năm 2018 là 590 triệu đồng; số tiền phí hải quan từ 1/1/2019 đến ngày 30/9/2019 là 438 triệu đồng.

Hiện nay, Cục Hải quan Nghệ An có phát sinh khoản thu đối với lệ phí hàng hóa, phương tiện quá cảnh tại Chi cục Hải quan cửa khẩu quốc tế Nậm Cắn và Chi cục Hải quan cửa khẩu cảng Cửa Lò. Các đơn vị đã thực hiện thu và nộp số tiền lệ phí hải quan vào NSNN. Tuy nhiên, chưa thực hiện kê khai lệ phí hàng hóa, phương tiện quá cảnh với cơ quan Thuế.

Lực lượng Hải quan - Biên phòng Nậm Cắn kiểm tra phương tiện NK qua cửa khẩu. Ảnh: H.Nụ

Cục Hải quan Nghệ An cho biết, các chi cục đã làm việc trực tiếp với chi cục thuế địa phương và được biết: Việc kê khai thuế, lệ phí hàng quá cảnh hàng tháng theo quy định thì đơn vị phải có mã số thuế đăng ký với cơ quan Thuế, trong khi đó, tại các chi cục hải quan không có mã số thuế. Việc chậm nộp NSNN đối với lệ phí hàng hóa phương tiện quá cảnh thì bị phạt chậm theo quy định (việc nộp lệ phí hàng hóa, phương tiện quá cảnh vào NSNN chậm nhất là ngày 20 hàng tháng). Việc kê khai chậm thì bị tính tiền chậm kê khai theo quy định hiện hành.

Căn cứ vào kết quả làm việc trực tiếp với cơ quan Thuế và tình hình thực tế tại Cục Hải quan Nghệ An phát sinh vướng mắc. Theo quy định tại Điểm b, Khoản 2, Điều 7 Thông tư 274/2016/TT-BTC quy định: “Cục hải quan các tỉnh, thành phố trực thuộc thành phố, chi cục hải quan các tỉnh chưa có cục hải quan thực hiện kê khai, nộp phí, lệ phí thu được theo tháng, quyết toán theo năm…”.

Theo thực tế khoản lệ phí hải quan do cấp chi cục thực hiện thu và nộp vào NSNN theo đúng mục (3000), tiểu mục (3002) của mục lục NSNN, cơ quan quản lý thu là cơ quan Hải quan (mã chương) do cấp chi cục quản lý. Như vậy, theo Cục Hải quan Nghệ An, việc kê khai với cơ quan Thuế sẽ do cấp cục kê khai hay do cấp chi cục thực hiện kê khai?

Cũng theo Cục Hải quan Nghệ An, Thông tư 174/2015/TT-BTC hướng dẫn kê toán nghiệp vụ thues và thu khác đối với hàng hóa XNK thì việc thu, nộp tiền lệ phí vào NSNN do cơ quan Hải quan quản lý thu sẽ được hạch toán vào hệ thống kế toán thuế tập trung của ngành Hải quan.

Hải quan Nghệ An cho rằng, việc cơ quan Hải quan thu và nộp lệ phí vào NSNN theo mã cơ quan thu của cơ quan Hải quan và hạch toán kế toán thuế tập trung của cơ quan Hải quan, đồng thời phải thực hiện kê khai với cơ quan Thuế địa phương như trên là chưa phù hợp.

Cục Hải quan Nghệ An cũng cho rằng, trường hợp khi kê khai với cơ quan Thuế sẽ dẫn tới việc chậm nộp NSNN đối với lệ phí hàng hóa, phương tiện quá cảnh thì bị phạt chậm theo quu định. Việc kê khai chậm thì bị tính tiền chậm kê khai theo quy định hiện hành.

Do đó, để đảm bảo việc kê khai và thu, nộp lệ phí hải quan kịp thời, chính xác đúng quy định, Hải quan Nghệ An đang đề nghị Tổng cục Hải quan hướng dẫn xử lý đối với việc kê khai phí, lệ phí hải quan theo Thông tư 274/2016/TT-BTC.