Doanh nghiệp cần lưu ý khi xác nhận nghĩa vụ thuế

Ngày 18/12/2025 Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư số 121/2025/TT-BTC sửa đổi, bổ sung một số điều của các thông tư quy định về thủ tục hải quan, kiểm tra, giám sát hải quan, thuế xuất nhập khẩu và quản lý thuế đối với hàng hoá xuất nhập khẩu (có hiệu lực từ ngày 1/2/2026).

Liên quan đến việc xác nhận hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế, tại khoản 61 Điều 1 Thông tư số 121/2025/TT-BTC quy định: “Khi có nhu cầu xác nhận việc thực hiện nghĩa vụ nộp thuế (bao gồm xác nhận số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt và các khoản đã nộp khác và/hoặc số tiền thuế đã nộp ngân sách nhà nước), người nộp thuế hoặc cơ quan quản lý nhà nước có thẩm quyền phải có văn bản đề nghị xác nhận hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế theo tiêu chí quy định tại mẫu số 05 Phụ lục Illa ban hành kèm thông tư này gửi đến cơ quan Hải quan thông qua Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan. Trường hợp nộp hồ sơ giấy, người nộp thuế hoặc cơ quan quản lý nhà nước có thẩm quyền gửi văn bản đề nghị xác nhận hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế theo mẫu số 34/CVXNHT/NVTHQ Phụ lục VI ban hành kèm thông tư này đến chi cục hải quan khu vực hoặc đơn vị hải quan (địa bàn mà chi cục hải quan khu vực không đóng trụ sở) nơi tổ chức, cá nhân có trụ sở chính hoặc trụ sở chi nhánh hoặc cơ sở sản xuất gần nhất”.

Hoạt động nghiệp vụ tại trụ sở cơ quan Hải quan.

Theo Cục Hải quan, quy định mới tạo ra sự linh hoạt tối đa thông qua việc song hành hai phương thức thực hiện dựa trên nền tảng hạ tầng của người nộp thuế. Đối với xu hướng số hóa, doanh nghiệp được ưu tiên gửi văn bản đề nghị dựa trên các tiêu chí chuẩn hóa tại mẫu số 05 Phụ lục IIIa trực tiếp qua Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan để tối ưu hóa thời gian xử lý.

Trong khi đó, để đảm bảo tính thích ứng cho các trường hợp đặc thù, hình thức nộp hồ sơ giấy vẫn được duy trì thông qua văn bản đề nghị theo mẫu số 34/CVXNHT/NVTHQ Phụ lục VI ban hành kèm thông tư.

Do đó, doanh nghiệp có nhu cầu xác nhận hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế thì có văn bản gửi chi cục hải quan khu vực hoặc đơn vị hải quan (địa bản mà chi cục hải quan khu vực không đóng trụ sở) nơi tổ chức, cá nhân có trụ sở chính hoặc trụ sở chi nhánh hoặc cơ sở sản xuất gần nhất để được xem xét xác nhận nghĩa vụ nộp thuế theo quy định.

Đáng chú ý, tính logic trong thẩm quyền xử lý đã được phân cấp rõ rệt nhằm đảm bảo tính sát thực của dữ liệu tại địa phương. Theo đó, hồ sơ phải được gửi đến chi cục hải quan khu vực hoặc đơn vị hải quan quản lý trực tiếp địa bàn nơi tổ chức, cá nhân đặt trụ sở chính, chi nhánh hoặc cơ sở sản xuất gần nhất. Việc xác định đúng cơ quan tiếp nhận không chỉ là điều kiện cần để đẩy nhanh tiến độ thẩm định mà còn giúp doanh nghiệp đồng bộ hóa dữ liệu hậu kiểm một cách hiệu quả nhất.

Khi phát sinh nhu cầu xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế, doanh nghiệp cần căn cứ vào mô hình vận hành hiện tại để lựa chọn phương thức tương tác và biểu mẫu tương ứng. Việc chủ động rà soát thông tin và gửi văn bản đến đúng cơ quan có thẩm quyền theo các hướng dẫn nêu trên sẽ giúp đơn vị được xem xét xác nhận kịp thời, đảm bảo quyền lợi và uy tín trong hoạt động sản xuất kinh doanh theo quy định mới.